Package medite :: Package MediteAppli :: Module synthetic :: Class TagFrequencyMatrix

Class TagFrequencyMatrix

     object --+    
              |    
FrequencyMatrix --+
                  |
                 TagFrequencyMatrix

Known Subclasses:: TagFrequencyMatrix2, TagFrequencyMatrix3

Matrice de fréquences de tags.

En ligne les modifications génétiques et en colonne les tags, self.freqGeneticModifs représentes les fréquences de tags pour chaque type de modif génétique, self.freqTexts représentes les fréquences de tags pour les 2 textes chaque ligne de freqGeneticModifs est en relation avec une ligne de freqTexts

Instance Methods

[hide private]

__init__(self, freqGeneticModifs, freqTexts)
#pre: isinstance(freqGeneticModifs,Numeric.array) # isinstance(freqTexts,Numeric.array)

source code

__str__(self)
str(x)

source code

setRelation(self, posGeneticModifs, posTexts)
Met en relation une partie du texte et un texte, par exemple insertion et texte cible.

source code

getRelation(self, posGeneticModifs)
pre: isinstance(posGeneticModifs,int)

source code

getNbLine(self)
Nombre total de lignes

source code

getFreqLine(self, index)
Renvoie une ligne de fréquence cad une ligne correspondant à une partie de texte

source code

getTextLine(self, index)
Renvoie la ligne de fréquence du texte source ou cible

source code

getFreqColumn(self, index)
Renvoie une colonne d'étiquettes

source code

getMaxGenetic(self)
Renvoie la valeur max sur la matrice de freq genetic

source code

getMaxText(self)
Renvoie la valeur max sur la matrice des 2 textes

source code

Inherited from FrequencyMatrix: getGraphLegend, getItemLegend, getMax, getNbColumn

Inherited from object: __delattr__, __getattribute__, __hash__, __new__, __reduce__, __reduce_ex__, __repr__, __setattr__

Properties

[hide private]

Inherited from object: __class__

Method Details

[hide private]

init(self, freqGeneticModifs, freqTexts)
(Constructor)

source code

#pre: isinstance(freqGeneticModifs,Numeric.array) # isinstance(freqTexts,Numeric.array)

Overrides: FrequencyMatrix.__init__

str(self)
(Informal representation operator)

source code

str(x)

Overrides: FrequencyMatrix.__str__

setRelation(self, posGeneticModifs, posTexts)

source code

Met en relation une partie du texte et un texte, par exemple insertion et texte cible.
pre: isinstance(posGeneticModifs,list)
        isinstance(posTexts,int)

getNbLine(self)

source code

Nombre total de lignes

Overrides: FrequencyMatrix.getNbLine

getFreqLine(self, index)

source code

Renvoie une ligne de fréquence cad une ligne correspondant à une partie de texte

Overrides: FrequencyMatrix.getFreqLine

Class TagFrequencyMatrix

__init__(self, freqGeneticModifs, freqTexts) (Constructor)

__str__(self) (Informal representation operator)

setRelation(self, posGeneticModifs, posTexts)

getNbLine(self)

getFreqLine(self, index)

init(self, freqGeneticModifs, freqTexts)
(Constructor)

str(self)
(Informal representation operator)