medite.MediteAppli.utile.chaineMot:
classe représentant une chaine de caractères à laquelle on peut
accéder mot par mot ou caractère par caractère le choix se fait à
la création avec le param carOuMot si processEnd alors on calcule
toute la table de correspondance mot_car sinon on évite ce calcul
et il sera fait à la demande avec testMotCar
medite.MediteAppli.utile.dict_chaines:
remplace le dictionnaire initial: hachage des chaines de facon à
ne stocker que les l_hach premiers elements en mode mot, on indexe
sur le nb de mots (et plus sur le nombre de car) et sur la chaine
de maximum l_hach premiers cararctères (comme en mode normal) et on
stocke comme valeurs les occurences en carctères (et pas en
mots)
medite.GUI.MainPanel.ComparaisonPanel2:
Classe du panel principal permettant d'afficher les informations
du dossier genetique courant les deux fenetres des états source et
cible, et les fenetres transformations et commentaire
medite.GUI.FMPanel.FMPanelHisto:
Frequency Matrix Panel, panel affichant une Matrice de
fréquences sous la forme d'un ensemble de graphiques en
histogrammes.
medite.MediteAppli.suffix_tree.GeneralisedSuffixTree:
Classe proxy qui construit un GeneralisedSuffixTree Celui-ci est
construit et on extrait les infos nécessaires pour trouver les MEM
Ensuite on supprime l'objet GeneralisedSuffixTree, ce qui permet
d'économiser beaucoup de mémoire
medite.MediteAppli.recouvrement.Recouvrement3:
Renvoie un dico indexé par un tuplet (cle,longueur) plutot que
par chaine[debut:fin], ce qui évite de stocker les chaines dans le
dico